当NERV的训练基地因为内部竞争而变得热火朝天时，一场看不见的瘟疫，正在东京这座都市的脚下，悄然蔓延。
小野田博士投下的那管“菌巢之心”
，在阴暗潮湿的下水道系统中找到了最完美的温床。
经过一段时间的发酵，淡黄色的菌丝网络已经彻底占据了包括东京、京都在内的数个核心版块的地下水道系统。
它如同一张巨大的神经网络，将城市的地下动脉彻底包裹、侵占，悄无声息地汲取着养分，积蓄着力量。
最初，生活在这座城市里的人们，只是从一些生活细节中，发现了一丝奇怪。
“奇怪，最近家里的下水道怎么老是堵？”
一位家庭主妇在厨房里，一边用疏通剂费力地处理着水槽，一边向丈夫抱怨，“通过一次，没两天又堵上了，水流下去的速度越来越慢。”
“是吗？我们公司厕所也是，物业都来修了好几次了，说是管道里长了些奇怪的滑腻腻的东西，怎么也清理不干净。”
她的丈夫看着报纸，随口应和道。
地铁站内，一名清洁工正费力地擦拭着站台边缘的地面。
“真是见鬼了，这几天地面怎么这么潮，拖了一遍又一遍，总感觉黏糊糊的，空气里还有股……说不出来的土腥味。”
他对着同事抱怨道。
市政厅的电话都快被打爆了，一名工作人员看着屏幕上急剧上升的报修工单，焦头烂额：“整个东京的排水系统流速下降了近40%！
派出去的检修队也查不出原因，管道里什么都没有，就是水流得慢！”
社交媒体上，也开始出现一些零星的帖子。
“【求助】有没有人知道，为什么我家猫最近老是冲着厕所的地漏哈气？跟见了鬼一样！”
“楼上+1，我家的狗也是，半夜老是冲着墙角狂叫，以前从来没有过。”
“你们有没有觉得，最近街上流浪猫狗的数量好像少了很多？”
这些零散的、看似毫无关联的异常现象，并没有引起人们足够的警惕。
对于一个拥有数千万人口的超级都市而言，这些都只是再平常不过的“城市病”
。
直到半个月后的一天，这份被忽略的异常，终于以一种最直观的方式，呈现在了所有人的面前。
傍晚，东京的一栋高级公寓楼内。
一名年轻的白领结束了一天的工作，正准备洗个热水澡。
当他走进浴室，打开花洒的瞬间，喷涌而出的，并非清澈的热水，而是一股混杂着黄色粘液的、散发着浓烈甜腥味的浑浊液体！
“什么东西？！”
他被这突如其来的一幕吓得连连后退。
而更恐怖的事情发生了。
从花洒的喷头里，从洗手池的下水口，甚至是从马桶里，一团团拳头大小、表面覆盖着粘液的菌丝球，开始向外涌出。
这些菌丝球在接触到空气后，便迅速膨胀、变形，长出了畸形的四肢，顶部则裂开，形成一张布满了细密利齿的口器。
一只只体型如同小型犬、形态酷似变异蘑菇的“孢子兽”
，就这样，从城市的每一个角落钻了出来！
“啊——！
！
！”