神宗末载，党祸已成。博罗韩文恪公思以力挽颓波，毅然中立。简在先帝，旦晚作辅。天祸宗社，哲人云亡。有丈夫子四，宗騋宗??宗??宗骊。騋最才，弱年名闻海内。公殂，太夫人在堂，闺玉掌珠，种种完好。以参空隐老人得悟，世缘立斩，与发同断，年二十有九耳。岁乙酉，以请藏经来金陵。值国再变，亲见诸死事臣，纪为私史，城逻发焉，傅律殊死，奉旨宥送盛京焚修。今弘法天山所群奉为祖心大师者也。当大师就缚对簿，备惨拷，讯所与游，忍死不语。囚于满人，厥妇张敬共顶礼之。既去，追之还。进曰，师无罪。此去必生。然窃有请也，师出万死，几不一生，不择于字，其祸至此。师生，无论好字丑字，毋更着笔。师为悚生。
又庐山栖贤函昰撰「千山剩人可和尚塔铭」略云：
及郝浴撰「奉天辽阳千山剩人可禅师塔铭」（参九龙真逸［陈伯陶］胜朝粤东遗民录肆「函可」条。）略云：
［华首道独］引入曹溪，礼祖下发。师是年二十有九，时崇祯十二年六月十九日也。甲申年三十有四，值世变再作，于戊子四月二十八日入沈，奉旨焚修慈恩寺，时已顺治五年矣。［后］师知悟门已开，且就化，目众叹曰，释儿识西来意乎？追念吾在家时，曾刺臂书经以报父。及出家，而慈母背，反立解条衣，披麻泣血，以葬之。是岂愚敢先后互左而行怪？顾创巨痛深，皆不知其然而然也。是西来意也。丙戌岁本以友故出岭，将挂锡灵谷。不自意方外臣少识忌讳，遂坐文字，有沈阳之役。是亦不知其然而然也。是西来意也。重示偈曰，发来一个剩人，死去一具臭骨。不费常住柴薪，又省行人挖窟。移向浑河波裏赤骨律。祗待水流石出。言讫坐逝。报龄四十九，僧腊二十。翼晨道颜如生。浴拊其背哭之，双目忽张，泪介于面。呜呼！师固博罗韩尚书文恪公之长子也。文恪公立朝二十年，德业声施在天下，门下多名儒巨人。故师得把臂论交。虽已闻法，而慈猛忠孝，恒加于贵人一等。甲申乙酉间，侨于金陵顾子之楼，友恸国恤，黯然形诸歌吟，不悟遂以为祸。然事干士大夫名教之重，江左旧史闻人往往执简大书，藏在名山。是殆狮象中之期牙雷管，而袈裟下有屈巷夔龙也。当其遭诬在理，万楚交下，绝而复苏者数，口齿皭然，无一语不根于道。血淋没趾，屹立如山，观者皆惊顾咋指，叹为有道。师始以逮入京，绝粒七日，时有一美丈夫手甘露瓶倒注其口，及蘧，神采益阳阳。方知大士留为十二年拨种生芽也。
寅恪案，前已考定牧斋因黄案被逮至南京，实在顺治四年丁亥四月。此时清廷委任江宁之最高长官乃洪亨九。钱洪两人于明季是否相识，今不得知，但牧斋与顾与治为旧交，弘光元年乙酉祖心由广东至南都，斯际牧斋正任礼部尚书。受之为当代词宗，尤博综内典。祖心既与顾氏亲密，寄居其寓楼，则钱韩两人极有往还之可能。巴山等举发函可案，在顺治四年丁亥十月。牧斋于四年四月被逮至南京入狱，历四十日出狱。其出狱之时间，当在五月。然则牧斋殆可经由顾韩之关系，向洪氏解脱其反清之罪。马国柱不过承继亨九之原议，而完成未尽之手续耳。检有学集壹秋槐诗集「禅关策进诗，有示」云：
或谓此诗在遵王注本中列于「顾与治五十初度」诗前第贰题。相距甚近，疑是为函可而作。但依郝浴所记，函可于顺治五年戊子四月二十八日入沈，「禅关策进」诗列于「岁晚过茂之，见架上残帙有感，再次申字韵」后第叁题。寿与治诗，前第贰题。岁晚诗既有「先祖岂知王氏腊，胡儿不解汉家春」，（寅恪案，郑氏近世中西史日表顺治五年戊子十二月廿二日立春。）寿顾诗复有「开尊信宿嘉平腊」等句，则禅关策进诗亦当是顺治五年戊子岁暮所赋，其非为函可而作可知。若不为剩和尚而作，则疑是为黄介子而赋也。前引孤忠后录载介子以顺治六年己丑三月，由广陵狱移金陵狱。若其所记时间稍有先后，则介子之移金陵狱，可能在顺治五年戊子岁暮。牧斋于其抵金陵时，即作此诗以相慰勉耶？俟考。又有学集壹秋槐诗集有「广陵舟中观程端伯画册，戏为作歌」七古一首，（寅恪案，端伯名正揆。事迹见光绪修孝感县志壹肆人物志及历代画史汇传叁叁程正揆传。）此诗前一题即「次韵林茂之戊子中秋白门寓舍待月之作」，故广陵舟中诗，当是顺治五年戊子秋间所赋。牧斋之至扬州，疑是就地与黄介子质证，盖是时介子尚在广陵狱中也。
复次，据郝浴所记，函可示寂前，有「丙戌岁本以友故出岭，将挂锡灵谷。不自意方外臣少识忌讳，遂坐文字，有沈阳之役」等语，显与清史列传洪承畴传谓函可「乙酉春自广东来江宁印刷藏经，值大兵平江南，久住未回」之言相冲突。详检千山诗集捌至玖之间，有补遗一卷，乃黄华寺主所藏函可丙丁间寓金陵所作之七律共三十一首。其中将返岭南前留别金陵诸友之诗颇多。如「次韵答邢孟贞［昉］并以道别」云，「高楼春尽恨难删」。「留别顾与治［梦游］」云，「一春花落鸟空愁」。「留别余澹心［怀］二首次韵」其一云，「春风犹滞秣陵关」及「三年不见云中信」。（寅恪案，千山诗集玖七律体中连载，「甲申岁除寓南安」，「乙酉元旦」「秋呓八首乙酉寓金陵作」，「乙酉除夕二首」，「丙戌元旦顾家楼」，「丙戌岁除巵亭同［邹］衣白［之麟］，［王］双白［廷璧］，［邹］方鲁［喆］诸子」，「丁亥元旦昧庵试笔」等题。此句「三年」之语，乃指甲申乙酉丙戌三岁而言，盖「留别余澹心」诗，赋于丙戌春暮也。）「留别白门诸公」云，「三山花落催行棹」及「莺啼无限夕阳多」。「次郑元白韵」云，「春残惟听白门笳」等，所言皆是暮春景物。（寅恪检邢孟贞昉石臼后集肆丁亥所作「送祖心归罗浮」七律，有「此日东风黯别颜」句，亦可参证。又沈归愚德潜国朝诗别裁叁贰载函可诗「丁亥春将归罗浮，留别黄仙裳」五律云，「春尽雨声裏，扬帆趁晓晴。路经三笑寺，归向五羊城。末世石交重，余生瓦钵轻。悲凉无限意，江月为谁明」。尤足证祖心于丁亥暮春有将返粤之事。）依洪承畴传谓巴山等牒送函可交亨九鞫讯，在顺治四年丁亥十月。由是推之，此次祖心之离南京，当在是年季秋，与暮春留别之诗不合。又黄华寺主所藏剩人补遗诗最后一题为「系中生日二首」。检千山诗集函可自作生日之诗不少。如卷陆「生日四首」，其一云，「且自欢兹会，明冬不可知」。卷玖「生日」云，「当年坠地即严冬」及卷壹柒「腊八」七绝前第贰题「丁酉生日」二首之二云，「每因生日知年近，又得浮生一岁添」。可知其生日乃在十二月初，亦与洪承畴传谓函可于十月被牒送者相合，而与暮春告别之诗不合。但「系中生日」诗前有「次余澹心韵二首」，其一云，「摩腾翻译浑多故，身外累累贝叶函」，（寅恪案，此两句与洪承畴传谓函可「来金陵印刷藏经」，「及城门盘验，经笥中有福王答阮大铖书稿」之记载相符。）其二云，「雁去休教虚只字，（寅恪案，全唐诗第壹函宋之问贰「题大庾岭北驿」云：「阳月南飞雁，传闻至此回。」故剩人此句，即取其意。）猿归应已共层崖」。又有「次林茂之韵二首」其一云，「篱边犹忆隔年花」。（寅恪案，此句用陶渊明「饮酒」二十首之四「采菊东篱下」，并杜子美「秋兴」诗「丛菊两开他日泪，孤舟一系故园心」之典故。盖取不仕刘宋，隐居遯世之高人及避羯胡乱，且未还家之词客，以比茂之。又剩人丙戌春暮返广东后，是岁再来南京，其时间或即在季秋，故与杜诗「两开」之语适合。所以有此推测者，因千山诗集玖有在南京所赋「丙戌岁除」之诗，则丙戌冬季以前，函可已由粤重来江宁矣。）其二云，「莫言我去知心少，但过墙东有好朋」等句，（寅恪案，后汉书列传柒叁逸民传逢萌传云，「避世墙东王君公」。剩人此句，殆指盛集陶。见下论牧斋「次韵答皖城盛集陶见赠二首」。）皆是秋季惜别之语。（寅恪又检石臼后集壹丁亥所作「再送祖心归岭南」五古，有「十月又逢梅」句，亦可参证。）然则，此二题四诗，乃函可于丁亥返粤告别之作也。颇疑函可实曾于顺治三年丙戌春暮由南京返广东，同年又重游南京。其临终所言「丙戌本以友故出岭，将挂锡灵谷」，即指此次而言。所谓「友」，恐是指亨九。灵谷寺在明太祖孝陵近旁，其欲居此寺，亦寓惓怀故国之思。亨九奏折讳言剩人回粤后，又重来金陵之事，必有隐衷。岂函可于丙戌一年之中，去而复返，实暗中为当时粤桂反清运动奔走游说耶？清史列传柒捌贰臣传甲洪承畴传云：
可知当时反清复明之势力皆欲争取亨九。巴山等拷问函可，即欲得知洪氏是否与此运动有关。洪氏避嫌，不定函可之谳，清廷亦深知其中微妙之处。所以谕慰洪氏，轻罪函可者，盖仍须藉洪氏以招降其他汉人士大夫如瞿稼轩辈。瞿洪皆中式万历丙辰进士，为同年生，而函可乃适当之联系人也。然则当日承畴处境之艰危，清廷手腕之巧妙，于此亦可窥见一斑矣。牧斋所以得免于死，其原因固多，恐亦与引诱稼轩一点有关欤？前引可和尚两塔铭，皆述函可系狱及械送北京途中，得蒙神力护持之事。所言殊诡异，盖暗示亨九辈阴为保全，故赖以脱死。观胜朝粤东遗民录肆「函可传」陈伯陶案语引张铁桥年谱，记后来洪承畴嘱岭东施起元照拂韩日缵诸子事。（寅恪案，同治修福建通志贰贰陆福清县施起元传略云：「施起元字君贞，一字虹涧。顺治己丑进士。从平藩南征入粤。七年授广东右参议，分守岭东道。八年摄学政，按试惠属，所拔悉当。旋以忧去。」可与陈氏所引参证。）足知亨九于剩人关系之密切也。又函昰谓可师「甲申之变，悲恸形辞色。传江南复立新主，顷以请藏，附官人舟入金陵」。夫乙酉春间，南都虽尚未倾覆，然长江当已戒严。函可之附官人舟至金陵，自不足怪。但函昰所以特着此语者，或因南都当局马士英阮大铖皆中式万历丙辰会试，可师乃其通家世好，此行乃与马阮有关耶？观其经笥中有福王答阮大铖书稿一事，亦可为旁证也。或谓千山诗集壹贰「寄陈公路若」有引，略云：
丙寅秋予侍先子南都署中，木樨盛开，月峰伯率一时词人赋诗其下。予虽学语未成，窃喜得一一遍诵。及薙发来南，与茂之相见，已不胜今昔之叹。今投荒又八年矣，赤公至，述长安护法，首举陈公，为吾乡人，即木樨花下赋诗人也。
检国榷卷首之三部院上南京礼部尚书栏载：
［天启六年］丙寅萧山来宗道甲辰进士。二月任。
［天启七年］丁卯博罗韩日缵丁未进士。三月任。
是丙寅岁任南京礼部尚书者，为来宗道，而非韩日缵。函可既误记「丁卯」为「丙寅」，则其临终时神志瞀乱，亦可误记「乙酉」为「丙戌」也。鄙意此说固可通，但检光绪修惠州府志叁贰人物门韩日缵传略云：
韩日缵字绪仲，号若海，博罗人。［天启四年］甲子，即家升右春坊右庶子。未行，升礼部右侍郎兼侍读学士，协理詹事府事，充两朝实录副总裁。次年（五年乙丑）升南京礼部尚书，疏辞弗克。崇祯［五年］壬申改礼部尚书。
吾国旧日社会关系，大抵为家族姻戚乡里师弟及科举之座主门生同年等。牧斋卒能脱免于黄案之牵累，自不能离此数端，而于科举一端，即或表面无涉，实则间接亦有关也。兹请参互推论之，虽未必切中肯要，然亦不至甚相远也。
前论牧斋热中干进，自诩知兵。在明北都未倾覆以前，已甚关心福建一省，及至明南都倾覆以后，则潜作复明之活动，而闽海东南一隅，为郑延平根据地，尤所注意，亦必然之势也。夫牧斋当日所欲交结之闽人，本应为握有兵权之将领，如第肆章论「调闽帅议」，即是例证。牧斋固负一时重望，而其势力所及，究不能多出江浙士大夫党社范围之外，更与闽海之武人隔阂。职是之故，必先利用一二福建士大夫之领袖，以作桥梁。苟明乎此，则牧斋所以特推重曹能始逾越分量，殊不足怪也。明史贰捌捌曹学佺传略云：
曹学佺字能始，侯官人。弱冠举万历二十三年进士，授户部主事，中察典，调南京添注，大理寺正。居冗散七年，肆力于学，累迁南京户部郎中，四川右参政按察使。又中察典议调。天启二年起广西右参议。初梃击狱兴，刘廷元辈主疯颠，学佺着野史纪略，直书事本末。至六年秋，学佺迁陕西副使，未行，而廷元附魏忠贤大幸，乃劾学佺私撰野史，淆乱国章。遂削籍，毁所镂板。崇祯初，起广西副使，力辞不就。家居二十年，着书所居石仓园中，为石仓十二代诗选，盛行于世。两京继覆，唐王立于闽中，起授太常卿，寻迁礼部右侍郎兼侍讲学士，进尚书，加太子太保。及事败，走入山中，投缳而死，年七十有四。诗文甚富，总名石仓集。万历中，闽中文风颇盛，自学佺倡之。晚年更以殉节着云。
南疆逸史壹柒曹学佺传略云：
学佺好学有文名，博综今古，自以宿学巨儒不得官京朝，历外数十年，仕又偃蹇，因以着书自娱。闽中立国，起为太常寺卿，上言今幅员褊小，税额无几，宜专供守战之用，而遣郑鸿逵疾抵关度防守，毋久逗留。诸逃兵肆掠，责令其收归营伍。及朝见，上指谓诸臣曰，此海内宿儒也。我在藩邸，闻其名久矣。时仓卒建号，一切典礼，皆学佺裁定。寻升礼部右侍郎，署翰林院事。时勅纂修威宗实录，国史总裁。设兰馆以处之。丙戌四月上在延津。朝议欲以奇兵浮海，直指金陵，而艰于聚饷，学佺倾家以万金济之。
初学集首载「牧斋先生初学集序」略云：
岁癸未冬海虞瞿稼轩刻其师牧斋先生初学集一百卷既成。冬月长至后，新安布衣友人程嘉燧述于松圆山居。
又「钱受之先生集序」云：
时崇祯甲申中秋节，友弟曹学佺能始识。
牧斋刻集既成之后，几历一年之久，复请能始补作一序。其推重曹氏如此，可为例证。又检初学集拾崇祯诗集陆「曹能始为先夫人立传，寄谢」云：
（诗略。）
同书壹陆丙舍诗集「得曹能始见怀诗，次韵却寄二首」云：
（诗略。）
有学集贰叁「张子石六十序」云：
子石游闽，余寓书曹能始，请为先太夫人传。子石摄齐升堂，肃拜而后奉书。能始深叹之，以为得古人弟子事师之礼。
夫牧斋平生于同时辈流之文章，少所许可，独乞曹氏为母作传。此举更足为其尊崇石仓之一例证也。但牧斋外集贰伍「题曹能始寿林茂之六十序」云：
余与能始宦途不相值，晚年邮筒促数，相与托末契焉。然予竟未识能始为何如人也。今年来白下，重逢茂之，剧谈能始生平，想见其眉目嚬笑，显显然如在吾目中，窃自幸始识能始也。顷复见能始所制寿序，则不独茂之之生平历历可指，而两人之眉目嚬笑，又皆宛然在尺幅中。天下有真朋友，真性情，乃有真文字，世人安得而知之。余往刻初学集，能始为作序。能始不多见予诗文，而想象为之，虽缪相推与，其辞藐藐云尔。读此文，益自恨交能始之晚也。虽然能始为全人以去，三年之后，其藏血已化碧，而予也楚囚越吟，连蹇不即死，予之眉目嚬笑，临流揽镜，往往自憎自叹，趣欲引而去之，而犹怅怏能始知予之浅也。不亦愚而可笑哉！戊子秋尽，虞山钱谦益撰于秦淮颂系之所。
列朝诗集丁壹肆「曹南宫学佺小传」略云：
能始具胜情，爱名山水，卜筑匡山之下，将携家往居，不果。家有石仓园，水木佳胜，宾友翕集，声伎杂进，享诗酒谈?之乐，近世所罕有也。着述颇富，如海内名胜志，十二代诗选，皆盛行于世。为诗以清丽为宗，程孟阳苦爱其送梅子庾「明月自佳色，秋钟多远声」之句。其后所至，各有集。自谓以年而异，其佳境要不出于此。而入蜀以后，判年为一集者，才力渐放，应酬日烦，率易冗长，都无持择，并其少年面目，取次失之。少陵有言「晚节渐于诗律细」，有旨哉，其言之也。
据此足见牧斋亦深知能始之诗文无甚可取。其请为母作传，并序初学集者，不过利用之以供政治之活动耳。又有学集肆柒「题徐孝白诗卷」云：
牧斋尺牍中「与毛子晋」四十六首之四十五云：
蕴生诗自佳，非午溪辈之比。须少待时日，与陈卧子诸公死节者并传，已有人先为料理矣。其他则一切以金城汤池御之。此间聒噪者不少，置之不答而已。