接下来的事态发展，基本上如同樱田纯所预感的那样，雪华绮晶在吸收了宝石的力量后获得了实体，拥有了行走在阳光下的机会。
唯一出乎意料的是，在雪华绮晶吸收宝石之力后，直接红光大盛，给他们换了个世界。
樱田纯：“”
怎么突然就穿了？他家真希还在原本的世界啊啊啊！
樱田纯站在陌生的米花町，崩溃地抓乱了自己的头发，再也不见平时人偶大师沉稳庄严的形象。
从此，樱田纯和雪华绮晶主仆二人走上了寻找回家方法的漫漫长路。
期间他们走了不少弯路，还被一个组织成员都是动物的组织发现了蔷薇少女人偶的秘密，不得不和对方虚与蛇委。
凭借雪华绮晶的能力，樱田纯不知不觉就混成了组织高层，获得了一个稀奇古怪中二气息十足的代号“dragon”。
这个单词意味着“龙”，也指“大型蜥蜴”。
樱田纯：“”
樱田纯表示嫌弃，但最后还是捏着鼻子认下了这个代号。
因为呆在动物园组织，他能得到有关这个世界的“潘多拉宝石”的一手消息。
是的，随着探查到的消息越来越多，樱田纯意识到他之前得到、现已被雪华绮晶吸收的宝石，就是“潘多拉”。
潘多拉，传说中的生命之石，由一块蓝宝石和一小块红宝石复合而成，外观上看起来是蓝宝石，却能在月光下能折射出红光，蕴含着无穷的生命力和能量内核，可以为人偶提供生命和活力，也能使人类延年益寿、甚至长生不老。
每个世界有且只有一颗潘多拉。
樱田纯想，既然当初他们通过他们世界的
“潘多拉”穿越到了这个世界，那么这个世界的“潘多拉”，很可能就是他们回家的穿越通道，他们必须要找到潘多拉。
这一找就是三年。
——在这期间，樱田纯意识到他们是穿越到了名侦探柯南的世界，想到樱田真希整天念叨的警校五人组，有尝试过去救唯一还没有牺牲的伊达航。
只可惜他本来就不太了解柯南的剧情，冥冥之中又有剧情之力在推动，伊达航最后还是被剧情杀了，樱田纯只来得及救下准备殉情的娜塔莉，借雪华绮晶之手送给她了一只和伊达航长得很像的人偶。
娜塔莉看到拥有生命的蔷薇少女人偶，在雪华绮晶有意无意的误导下，萌生了伊达航可能会在人偶身体中复活的希望，于是带着伊达航人偶回到了北海道老家，过上了工作养人偶的平静生活。
这便是娜塔莉成功脱离死亡结局的原因。
再说回“潘多拉”。
为了获取潘多拉的相关情报，樱田纯一直卧底在动物园组织卧底，并在三个月前真正发现了潘多拉的踪迹，比动物园组织更抢先一步，得到了这个世界的“潘多拉”。
而当两枚潘多拉宝石同时出现的时候，樱田纯一瞬间窥探到了世界背后的运行轨迹——两枚潘多拉所代表的两个平行世界，正在进行世界融合。
原来，不论是樱田纯原本的世界，还是现在穿越过来的世界，其实都是从动漫衍生而来的、有缺陷的世界。
蔷薇少女和蜡笔小新世界的组合世界，不但有滞留在此的第七人偶雪华绮晶，还要接连不断遭遇外星人入侵和地球危机。
柯南世界则是以米花町为重灾区圆心杀人事件频发，子弹与炸弹齐飞，四季年月日时间陷入混乱。
为了避免世界彻底陷入无法挽救的混乱，两个选择世界融合自救，通过融合来互相弥补各自世界的致命缺陷。
当然，世界融合并不是一件简单的事，需要两个世界身负大气运的主人公们之间产生接触，双方的联系越紧密，世界的融合进度也就越顺利。
于是潘多拉宝石作为促进两个世界融合的桥梁登场。
樱田纯“幸运”得到两枚潘多拉，潘多拉在樱田真希的工作室“被摔碎”分裂，警校组在人偶身体中“复活”，樱田真希和小人偶们的互穿，震撼值进度条，安室透手机中出现的群聊——这些都是冥冥之中，潘多拉为了促进两个世界融合而发挥的作用。
听完松田阵平和萩原研二的转述，大家大为震撼。
他们有预想到这件事不会简单，但没想到竟然这么不简单！
连世界融合这种事情都要发生了！
尤其其中还涉及到动物园组织和难以控制的潘多拉这个变量，大家的表情一个个变得严肃起来。
只有樱田真希没被逐渐沉重的空气影响，眼睛一亮：“所以以后我经常能来米花町串门了吗？！”