“好，既然主公如此不惮冒险一试，那国用也就舍命陪君子了，哈哈！”
五百人很快就被挑选了出来，他们也算是戴罪之身，今见元璋这般安排，心底里都更加发虚了，不知将要被如何发落。
到了这天夜晚，元璋便让那五百人皆入自己的亲军中任护卫，而先前的亲兵、随从则统统被打发走了，独留冯国用一人侍奉在卧榻之旁。
众人只见元璋坦然地解甲酣寝，与往日无异，不禁窃窃私语起来，一个指着就寝的元璋说道：“人家都说那一位诡计多端，他今天唱的又是哪一出？”
另一个道：“若是我等即刻下手，他必不能活命，你说他唱的是哪一出？”
第三个又道：“朱公这是把我等当成自己人了啊，大伙可不要以小人之心度君子之腹！”
这种争论一直不休，直等到次日黎明时分，那五百兄弟才算都明白了元璋赤诚相见的意思，心里被感动得厉害，于是疑惧顿消，纷纷来向元璋表忠心道：“朱公倾心以待我等，我等无以为报，只愿此次攻打集庆做先锋！”
元璋眼见成功收服了人心，不禁心下大喜，他强忍住兴奋，道：“好！那咱就成全尔等所请吧！”
等到攻打集庆城时，这五百兄弟无不奋勇争先，多有先登临陷阵者，为此也获得了不少的赏赐，上下人心一片欢悦。
江宁既已拿下，元璋于是挥师直指集庆城，当时水陆各军有近十万之众，可谓气势空前。
当距离城池还有四五里处时，士气高涨的朱家军便开始鼓噪而进，大造声势。而城中元军先前已经一败再败，今又见势单援绝，早已毫无斗志，等到大兵压城时，几乎都被吓得龟缩在城中不敢动弹了，更有像康茂才等人，也早就派人来向元璋暗中输诚了。
身为行台御史大夫的福寿却是个坚定的抵抗分子，他督师出战，元璋远远地看到这一幕，便招呼道：“谁愿前往打退此敌！”
“末将愿往！”一道声音从队伍里传出。
“好！”元璋当时丝毫不把这伙敌兵放在眼里，所以哪位将领出战他也就没有放在心上，等到那员将领打马跑到他前面去时，他才发现居然是文正这小子。
元璋也只好由他去了，只见朱家军一阵猛攻便将福寿所部给顶了回去，这伙敌兵只得改为闭城坚守。具体交战情形元璋尚没有看清楚，但待到文正返回时，元璋还是不由得夸赞道：“好小子！”
元璋当即命令将士们以云梯火速登城，城下又配合以大批弓箭、火器进行有力支援，城上的元军被打得晕头转向；同时，水路也加强了攻势，在两路大军的夹击下，元军顾此失彼，才半天工夫，偌大的集庆城就被攻破了。
当朱家军杀入集庆城时，福寿还在督兵巷战，负隅顽抗，他的部将都劝他赶快逃走，结果怒极的福寿一面斥骂着众人，一面竟拿箭射向那些劝阻他的人。只听福寿嘴里大声喊道：“谁敢再劝本大人临阵脱逃，就先把他射死！”众人不敢再上前劝阻，力战不退的福寿终为乱兵所杀。
此外，已成为平章的阿鲁厌、参政伯家奴及集庆路达鲁花赤达尼达思等人，皆为元廷尽忠战死。元璋将这些人的尸体收集起来，进行了集中埋葬，他指示道：“他们也都是元廷的死节忠臣，理当厚葬！”
朱家军共计俘获了御史王稷、元帅李宁等三百余名文武官员，唯独跑了蛮子海牙，走投无路的他不久后只得投靠了张士诚兄弟。苗军元帅寻朝佐、阿鲁厌部将完都等人，在水寨元帅康茂才及水军元帅叶撒的引领下，皆率部投降。此次归降的元朝军民共计五十余万。
人丁详表被呈递到元璋书案前，他细细地看过之后，不免感慨地对身边的冯国用说道：“从先生提出金陵规划到如今，已近三个年头。当初咱也只是想想，不承想今日果然美梦成真，真是上天厚待我等了！圣人言三十而立，咱今年虚岁不过二十九，适足以当之了，更当时时小心处置，锐意进取以应天命！”
冯国用拱了拱手，欣然道：“今日我等夺取金陵，虽是人力，终归也是天命使然，而天命即在乎顺应人心！只愿主公戒惧戒慎，再接再厉！”
元璋忍不住上前扶住冯国用，道：“咱何德何能，竟有今日！若非得到了先生之辅弼，咱恐怕仍是淮西一草寇，只愿今后先生知无不言，言无不尽，咱定当择善而从！请先生受咱一拜！”说着，他向冯国用拱手一拜。
为了迅速安定人心，入城后的元璋立即晓谕全城：
元失其政，所在纷扰，兵戈并起，生民涂炭。汝等处危城之中，朝夕惴惴不能自保。吾率众至此，为民除乱耳。汝宜各安职业，毋怀疑惧。贤人君子有能相从立功业者，吾礼用之。居官者慎毋暴横以殃吾民。旧政有不便者，吾为汝除之。
集庆的百姓们都奔走相告，消息迅速传遍了全城，他们又见市井肃然，心里才稍稍安定了些。
为了有别于胡元旧制，及赋予一种恢宏远大的意蕴，元璋又在陶安等人的建议下，下令将集庆路改为“应天府”，其意在“顺天应人”以就大业。后来，又设置了上元、江宁二县，作为应天府的属县。
另外，还设置了天兴、建康翼统军大元帅府，以廖永安为统军元帅；以新近归附的赵忠为兴国翼元帅，镇守太平。不久，元璋突然发觉太平的江防地位异常重要，可谓是应天府真正的西大门，必须加派一名亲信大将镇守此处，于是又在太平设置了行枢密院，以身为总管的花云为院判。从此花云就在太平一连坐镇了四年，直到城破而死。
就在花云临行前，元璋还特意叮嘱他道：“花云啊，你是咱的心腹爱将，又厥功至伟，论武艺、才干，自然是没说的，不然也不会派你去！但是你读书太少，有些事情必得多听听读书人的才好，俗话说‘听人劝，吃饱饭’嘛！那李习有些老了，咱用他在太平不过是为着过渡一下！你放心，来日太平城的知府咱一定遴选一位德才兼备的可靠之人，你务必与他协力同心，为咱当好上游屏障！”
“主公放心，该俺管的事俺绝不懈怠，一应民事则断然不会插手！”花云顿首道。
“好，咱信得过你！”元璋拍着他的肩膀说道，“遇上大事一定要来书告知咱，不过切记，不可轻易亲自跑到咱这里来。江上往来虽然便利，可你身为大将，职守重大，万万不可轻动！”
从此以后，花云只是在重大节庆里才到应天来一次，四年里总共才跑了四五次。