临行前，朱允熥对林远说：“林大师，飞龙号的建造必须继续，但要加强保密和防护。我怀疑有人想破坏我们的工作。”
林远肃然应诺：“殿下放心，老朽一定严加防范。”
朱允熥又调派了一队神机营士兵驻守船厂，确保飞龙号的安全，然后星夜兼程返回应天府。
回到应天府后，朱允熥立即入宫求见朱元璋，详细汇报了北方边境的情况和船厂的进展。
朱元璋听完，眉头紧锁：“瓦剌人又想入侵，而且还有火器？这可不是小事。”
朱允熥分析道：“皇爷爷，瓦剌人自古以游牧为生，不擅长制造精密火器。他们的火器技术很可能来自外部，甚至可能是我大明内部有人提供的。”
朱元璋微大怒：“你是说，还有人暗中勾结瓦剌人？”
“这种可能性不能排除。”朱允熥郑重地说，“孙儿请求皇爷爷下令彻查此事，同时加强边境防务，防止瓦剌人突袭。”
朱元璋沉吟片刻，拍案决定：“准！朕命你统领神机营，前往北方边境，查明情况并击退瓦剌人的入侵。同时，锦衣卫会暗中调查是否有人勾结外族。”
朱允熥本想继续监督飞龙号的建造，但国家安全更为重要。他郑重接令：“孙儿遵旨！”
离开皇宫后，朱允熥立即着手准备。他召集神机营将领，制定作战计划，并派人密切监视朱允炆的党羽，防止他们趁机捣乱。
就在朱允熥忙于军事部署时，他收到了来自杭州船厂的紧急消息：有人企图潜入船厂，破坏飞龙号！
“果然如此！”朱允熥怒不可遏，“这些人真是不肯善罢甘休！”
幸好神机营士兵戒备森严，成功抓获了几名刺客。经审讯，这些人承认受雇于一名神秘人物，目的就是破坏飞龙号的建造。
“继续严加审讯，一定要查出幕后主使！”朱允熥下令道，同时加派人手保护船厂。
北方边境的军情越发紧张，朱允熥不得不暂时搁置飞龙号的事，专心应对瓦剌人的威胁。他率领神机营出征，离开应天府，直奔北方边境。
这一走，就是一个月。
神机营在朱允熥的指挥下，连续击退了瓦剌人的多次试探性进攻，俘虏了数名瓦剌士兵。让朱允熥惊讶的是，这些瓦剌士兵确实装备了火器，虽然品质不如神机营的精良，但也颇具威力。
更令人震惊的是，经过审问，竟发现这些火器是通过江南一带的商人秘密提供的！
“江南商人？”朱允熥立刻想到了江南四大家族，“难道是他们在背后支持瓦剌人？”
为了查清真相，朱允熥派出得力助手秘密潜入江南，调查这些商人的背景和活动。
同时，他也没有忘记飞龙号的建造。通过书信，朱允熥不断与林远沟通，解决建造过程中遇到的各种问题。
在前线的日子里，朱允熥经常抽空思考如何改进飞龙号的设计，尤其是在看到瓦剌人的火器后，他更加确信要在飞龙号上装备强大的火炮系统。